Pendaftaran mahasiswa baru STIE Mahardhika Surabaya untuk tahun akademik 2018-2019 telah dibuka. Pendaftaran berlaku bagi program sarjana (S1) maupun program pascasarjana (S2). STIE Mahardhika juga menerima pendaftaran mahasiswa alih jenjang dari D3 ke S1 atau mahasiswa transfer/pindahan dari kampus lain dengan syarat memiliki transkrip nilai resmi dari kampus lama.
Di STIE Mahardhika tidak ada sistem gelombang, pendaftaran hanya diselenggarakan sekali dan sewaktu-waktu akan tutup jika kuota terpenuhi.